PET-CT体检的很大劣势是价格较贵
做一次PET-CT全身检查全国价格较低的地区是上海，也要7500元一次，对于普通老百姓是两三个月工资，确实很难舍得花这个钱，于是做PET-CT体检就成了一种高端体检项目。很多专家在几年前就开始讨论PET-CT检查费用的医保报销问题，目前只有极少部分地区PET-CT检查的药物可以报销，这也是一点曙光。
PET-CT体检的副作用是辐射
日本福岛核电站核泄漏事故以后，人们对辐射的理解也逐渐增加。做一次PET-CT检查所产生的辐射相当于做两次CT的辐射量，是医学界检测人体可以接受的安全剂量。病人做一次PET-CT检查确实承受了一定量的辐射，但这样的一次PET-CT影像学诊断，是医生对病灶的准备定位、治疗方案的合理运用及全身是否还有其他转移病灶等情况掌握的有效依据，我们知道癌症需要早预防早治疗，治疗是抗癌的第一步。
目前，PET-CT影像学检查是医学界发现肿瘤的十分优等医学仪器，更是治疗肿瘤阶段主治医生的得力助手。
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